El Centro de Formación y Producción de Grabado, ubicado en el segundo nivel del museo, funciona desde 1999, gracias al apoyo del CONACULTA y del Gobierno del Estado de Zacatecas. Opera en coordinación con el Centro Nacional de las Artes y el Instituto Zacatecano de Cultura. Las técnicas en las que se especializa el taller son la litografía y el grabado.

Desde su apertura ha recibido a renombrados artistas. Entre los que han visitado el taller se encuentran José Luis Cuevas, Vicente Rojo, Antonio Peyri, Luis López Loza, Gabriel Macotela, Francisco Castro Leñero, Irma Palacios y Jordi Boldó. La obra aquí producida forma parte del acervo del museo.